El Colegio inicio labores el 10 de Septiembre de 1956 en el anexo del Santuario de Nuestra Se
ñora de Guadalupe. Fue fundado por Mons. J. Enrique Mejia Razura, quien Le dio el nombre de "Fray Junipero Serra" en honor a este siervo de Dios que dedico su vida a evangelizar a los indágenas. Luego de 9 años y debido a su rapido crecimiento, así como a la necesidad de cumplir con su finalidad principal de aten¬der a niños de escasos recursos económi¬cos, el lugar demandó mayor espacio por lo que se cambió a los anexos del templo del Purísimo Corazón de María.
EL Cole¬gio siguió creciendo y con la ayuda de maestros, alumnos, exalumnos, padres de familia y el entonces Gobernador Constitucional del Estado, el C. Emilio M. González, la escuela quedo instalada en su domi¬cilio actual en el año de 1985, contando con preescolar y primaria. En 1986 inicio labores por la tarde la sección secundaria con el nombre de "Abraham Lincoln", cambiando al turno matutino en el ciclo escolar 1991-92 y tomando el nombre del resto del colegio.
En ese mismo ciclo inició labores en el turno vespertino la sección preparato¬ria hasta el año 2002 en que cambio al turno matutino. Al finalizar el periodo escolar 1991-92 la escuela fue entregada por el Padre Mejía a la Diocesis de Tepic. Tiempo después, el 8 de Julio Mons. Enrique Mejía falleció. Sin embargo su obra continua y actualmente se cuenta con los niveles de preescolar, primaria, secundaria y preparatoria en el turno matutino siempre con la asesoría y supervision del Excelentisimo Señor Obispo Alfonso Humberto Robles Cota.
SITUACION ACTUAL
En la actualidad cuenta con jardín de niños, primaria, secundaria y preparatoria,
En todos los sábados esta la escuela de pastoral en donde te enseñan en leer la bíblica y todo lo referente a la religión católica
